MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 90347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009484	ACGC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	148259022
2	NC_009484	GAA	2	6	381	386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259022
3	NC_009484	TGC	2	6	427	432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259022
4	NC_009484	TGC	2	6	463	468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259022
5	NC_009484	CTG	2	6	513	518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259022
6	NC_009484	CGG	2	6	544	549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259022
7	NC_009484	CGGC	3	12	573	584	0 %	0 %	50 %	50 %	148259022
8	NC_009484	AGCG	2	8	588	595	25 %	0 %	50 %	25 %	148259022
9	NC_009484	CG	3	6	594	599	0 %	0 %	50 %	50 %	148259022
10	NC_009484	CG	3	6	635	640	0 %	0 %	50 %	50 %	148259022
11	NC_009484	CGC	3	9	644	652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259022
12	NC_009484	GC	3	6	654	659	0 %	0 %	50 %	50 %	148259022
13	NC_009484	GC	3	6	688	693	0 %	0 %	50 %	50 %	148259022
14	NC_009484	CGAA	2	8	739	746	50 %	0 %	25 %	25 %	148259022
15	NC_009484	GC	4	8	760	767	0 %	0 %	50 %	50 %	148259022
16	NC_009484	CGG	2	6	818	823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259022
17	NC_009484	TGG	2	6	1003	1008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259022
18	NC_009484	AGG	2	6	1045	1050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259022
19	NC_009484	TTC	2	6	1053	1058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259022
20	NC_009484	ATC	2	6	1095	1100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259022
21	NC_009484	CGGCT	2	10	1158	1167	0 %	20 %	40 %	40 %	148259022
22	NC_009484	CG	3	6	1235	1240	0 %	0 %	50 %	50 %	148259022
23	NC_009484	CGT	3	9	1247	1255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259022
24	NC_009484	AGA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259022
25	NC_009484	TGC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259022
26	NC_009484	GAG	2	6	1434	1439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259022
27	NC_009484	TCC	2	6	1488	1493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259022
28	NC_009484	GC	5	10	1499	1508	0 %	0 %	50 %	50 %	148259022
29	NC_009484	AGC	2	6	1549	1554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259022
30	NC_009484	ACC	2	6	1608	1613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259022
31	NC_009484	CTG	2	6	1683	1688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259022
32	NC_009484	GGCG	2	8	1745	1752	0 %	0 %	75 %	25 %	148259023
33	NC_009484	GAA	2	6	1788	1793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259023
34	NC_009484	CCT	2	6	1811	1816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259023
35	NC_009484	CGC	2	6	1845	1850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259023
36	NC_009484	CGG	2	6	1901	1906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259023
37	NC_009484	CGA	2	6	1916	1921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259023
38	NC_009484	GGCC	2	8	1926	1933	0 %	0 %	50 %	50 %	148259023
39	NC_009484	GC	3	6	1975	1980	0 %	0 %	50 %	50 %	148259023
40	NC_009484	TTC	2	6	2092	2097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259023
41	NC_009484	GC	3	6	2111	2116	0 %	0 %	50 %	50 %	148259023
42	NC_009484	CCCA	2	8	2121	2128	25 %	0 %	0 %	75 %	148259023
43	NC_009484	CG	4	8	2150	2157	0 %	0 %	50 %	50 %	148259023
44	NC_009484	TGA	2	6	2180	2185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259023
45	NC_009484	CGT	2	6	2291	2296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259023
46	NC_009484	ATA	2	6	2427	2432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148259023
47	NC_009484	CGC	2	6	2451	2456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259023
48	NC_009484	GCG	2	6	2462	2467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259023
49	NC_009484	GCC	2	6	2535	2540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259023
50	NC_009484	GGCTTC	2	12	2941	2952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259024
51	NC_009484	GGC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259024
52	NC_009484	GGC	2	6	3006	3011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259024
53	NC_009484	AGA	2	6	3038	3043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259024
54	NC_009484	GCG	2	6	3079	3084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259024
55	NC_009484	GAC	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259025
56	NC_009484	GGC	2	6	3770	3775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259025
57	NC_009484	CAGC	2	8	3842	3849	25 %	0 %	25 %	50 %	148259025
58	NC_009484	CGCC	2	8	3851	3858	0 %	0 %	25 %	75 %	148259025
59	NC_009484	CG	3	6	3872	3877	0 %	0 %	50 %	50 %	148259025
60	NC_009484	CG	4	8	3957	3964	0 %	0 %	50 %	50 %	148259025
61	NC_009484	GCT	2	6	4073	4078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259025
62	NC_009484	GCG	2	6	4122	4127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259025
63	NC_009484	GCC	2	6	4191	4196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259025
64	NC_009484	CGC	2	6	4244	4249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259026
65	NC_009484	G	6	6	4284	4289	0 %	0 %	100 %	0 %	148259026
66	NC_009484	CGA	2	6	4307	4312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259026
67	NC_009484	GCC	3	9	4317	4325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259026
68	NC_009484	TCG	2	6	4384	4389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259026
69	NC_009484	TCG	2	6	4500	4505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259026
70	NC_009484	GGC	2	6	4523	4528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259026
71	NC_009484	CGC	2	6	4565	4570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259026
72	NC_009484	GCCG	2	8	4646	4653	0 %	0 %	50 %	50 %	148259026
73	NC_009484	CATGGG	2	12	4658	4669	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148259026
74	NC_009484	AGG	2	6	4720	4725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259026
75	NC_009484	GCCA	2	8	4737	4744	25 %	0 %	25 %	50 %	148259026
76	NC_009484	GGC	4	12	4751	4762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259026
77	NC_009484	GGA	2	6	4826	4831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259026
78	NC_009484	AGCC	2	8	4879	4886	25 %	0 %	25 %	50 %	148259026
79	NC_009484	CCG	2	6	4909	4914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259026
80	NC_009484	CCT	2	6	4918	4923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259026
81	NC_009484	CGC	2	6	4924	4929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259026
82	NC_009484	CCG	2	6	4945	4950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259026
83	NC_009484	GGA	2	6	4964	4969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259026
84	NC_009484	CGC	2	6	4993	4998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259026
85	NC_009484	CG	3	6	5000	5005	0 %	0 %	50 %	50 %	148259026
86	NC_009484	GC	3	6	5032	5037	0 %	0 %	50 %	50 %	148259026
87	NC_009484	CAT	2	6	5042	5047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259026
88	NC_009484	CGC	2	6	5063	5068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259026
89	NC_009484	GCTC	2	8	5081	5088	0 %	25 %	25 %	50 %	148259026
90	NC_009484	GC	3	6	5187	5192	0 %	0 %	50 %	50 %	148259026
91	NC_009484	GGC	2	6	5264	5269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259026
92	NC_009484	GCT	2	6	5273	5278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259026
93	NC_009484	GGC	2	6	5289	5294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259026
94	NC_009484	CGG	3	9	5321	5329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259026
95	NC_009484	CGC	2	6	5419	5424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259027
96	NC_009484	AGG	2	6	5475	5480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259027
97	NC_009484	TGA	2	6	5482	5487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259027
98	NC_009484	GCGA	2	8	5506	5513	25 %	0 %	50 %	25 %	148259027
99	NC_009484	GAA	2	6	5524	5529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259027
100	NC_009484	TCC	2	6	5552	5557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259027
101	NC_009484	CGCGC	2	10	5558	5567	0 %	0 %	40 %	60 %	148259027
102	NC_009484	CGACTG	2	12	5614	5625	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148259027
103	NC_009484	TCG	2	6	5628	5633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259027
104	NC_009484	GGT	2	6	5707	5712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259027
105	NC_009484	GTC	2	6	5713	5718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259027
106	NC_009484	CCA	2	6	5727	5732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148259027
107	NC_009484	TGA	2	6	5748	5753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259027
108	NC_009484	TCA	2	6	5787	5792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259027
109	NC_009484	CTT	2	6	5797	5802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259027
110	NC_009484	GCT	2	6	5824	5829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259027
111	NC_009484	CCGGC	2	10	5841	5850	0 %	0 %	40 %	60 %	148259027
112	NC_009484	CGT	2	6	5893	5898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259027
113	NC_009484	GATCGA	2	12	6004	6015	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148259027
114	NC_009484	TGG	2	6	6084	6089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259027
115	NC_009484	CTCG	2	8	6118	6125	0 %	25 %	25 %	50 %	148259027
116	NC_009484	GCT	2	6	6130	6135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259027
117	NC_009484	ATG	2	6	6158	6163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259027
118	NC_009484	AAG	2	6	6215	6220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259027
119	NC_009484	GGC	2	6	6227	6232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259027
120	NC_009484	CTCG	2	8	6280	6287	0 %	25 %	25 %	50 %	148259027
121	NC_009484	CGG	2	6	6291	6296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259027
122	NC_009484	GGC	2	6	6315	6320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259027
123	NC_009484	AAG	2	6	6359	6364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148259027
124	NC_009484	CGC	2	6	6478	6483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259027
125	NC_009484	TCG	2	6	6566	6571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259027
126	NC_009484	CGA	2	6	6586	6591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259027
127	NC_009484	CGC	2	6	6600	6605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259027
128	NC_009484	GCT	2	6	6655	6660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259027
129	NC_009484	GGC	2	6	6677	6682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259027
130	NC_009484	CG	3	6	6698	6703	0 %	0 %	50 %	50 %	148259027
131	NC_009484	TGC	3	9	6711	6719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259027
132	NC_009484	TCGA	2	8	6827	6834	25 %	25 %	25 %	25 %	148259027
133	NC_009484	GC	3	6	6919	6924	0 %	0 %	50 %	50 %	148259027
134	NC_009484	CGGGC	2	10	6925	6934	0 %	0 %	60 %	40 %	148259027
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252	NC_009484	CGCT	2	8	11622	11629	0 %	25 %	25 %	50 %	148259031
253	NC_009484	CAG	2	6	11669	11674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259031
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255	NC_009484	CGCGG	2	10	11714	11723	0 %	0 %	60 %	40 %	148259031
256	NC_009484	GATGCA	2	12	11902	11913	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148259032
257	NC_009484	GTG	2	6	11948	11953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259032
258	NC_009484	TCT	2	6	11965	11970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259032
259	NC_009484	CGC	3	9	12025	12033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259032
260	NC_009484	GCA	2	6	12119	12124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259032
261	NC_009484	G	8	8	12127	12134	0 %	0 %	100 %	0 %	148259032
262	NC_009484	GGCG	2	8	12136	12143	0 %	0 %	75 %	25 %	148259032
263	NC_009484	GGC	2	6	12181	12186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259032
264	NC_009484	CG	3	6	12191	12196	0 %	0 %	50 %	50 %	148259032
265	NC_009484	CG	3	6	12210	12215	0 %	0 %	50 %	50 %	148259032
266	NC_009484	GCA	2	6	12227	12232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259032
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268	NC_009484	TGGT	2	8	12454	12461	0 %	50 %	50 %	0 %	148259033
269	NC_009484	CGG	2	6	12467	12472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259033
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384	NC_009484	CGGCTT	2	12	17549	17560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259041
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388	NC_009484	GGC	2	6	17671	17676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259041
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391	NC_009484	CGC	2	6	17777	17782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259041
392	NC_009484	GC	4	8	17784	17791	0 %	0 %	50 %	50 %	148259041
393	NC_009484	GGC	2	6	17846	17851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259041
394	NC_009484	GCA	2	6	17857	17862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259041
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396	NC_009484	GCCG	2	8	17897	17904	0 %	0 %	50 %	50 %	148259041
397	NC_009484	CGG	3	9	17981	17989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259041
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401	NC_009484	GCGG	2	8	18188	18195	0 %	0 %	75 %	25 %	148259041
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499	NC_009484	GCC	2	6	22566	22571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259046
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